miconv - クラウドでオンライン

プログラム：

NAME

miconv-医用画像データをフォーマット間で変換します。

SYNOPSIS

マイコン [オプション] []

DESCRIPTION

miconv：医用画像データをフォーマット間で変換します。

ファイル形式は、ファイル拡張子によって自動的に識別されます。 それはで期待しています
の最後に少なくともXNUMXつのファイル名/ディレクトリ（入力ファイルと出力ファイル用）
コマンドライン。 例外は、XNUMXつだけを必要とするオプション'-l'です。
その内容をリストするファイル名/ディレクトリ。

オプション：
-l：スペースで区切られたプロトコルパラメータと出口のセットを一覧表示します。 '-lhelp'を使用して
可能なパラメータのリストと、すべてのパラメータをリストするための「-lall」。 パラメータ
このオプションを使用する場合は、「output-file」を省略する必要があります。

-p：デフォルトの場合はこのプロトコルをロードします

プロトコール オプション：
-日付：スキャンの日付[yyyymmdd]（デフォルト= 20140807yyyymmdd）

-fp：位相方向のFOV [mm]（デフォルト= 220.0mm）

-NS：読み取り方向のFOV [mm]（デフォルト= 220.0mm）

-fs：スライス方向のFOV [mm]（デフォルト= 5.0mm）

-番号：連続測定数（デフォルト= 1）

-nx：読み取り方向のポイント数（デフォルト= 128）

-ny：位相方向のポイント数（デフォルト= 128）

-nz：スライス方向のポイント数（デフォルト= 1）

-p誕生：患者の生年月日[yyyymmdd]（デフォルト= 00000000yyyymmdd）

-pid：一意の患者識別子（デフォルト=不明）

-pname：完全な患者名（デフォルト=不明）

-psex：患者の性別（オプション= MFO、デフォルト= O）

-pweight：患者の体重[kg]（デフォルト= 50.0kg）

-科学者：科学者名（デフォルト=不明）

-SD：スライス間距離（中心から中心まで）[mm]（デフォルト= 10.0mm）

-サード：シリーズの説明（デフォルト=不明）

-セルノ：シリーズ番号（デフォルト= 1）

-st：スライス厚[mm]（デフォルト= 5.0mm）

-スタッド：研究の説明（デフォルト=不明）

-tcname：送信コイルの名前（デフォルト=不明）

-お茶：シーケンスのエコーまでの時間[ms]（デフォルト= 80.0ms）

-時間：スキャン時間[hhmmss]（デフォルト= 091009hhmmss）

-tr：連続励起間の時間[ms]（デフォルト= 1000.0ms）

File read オプション：
-cplx：データを複雑なものとして扱い、指定されたコンポーネントを抽出します（options = none abs pha real
imag、default = none）

-ds：複数のデータセットが読み取られた場合に抽出するデータセットインデックス

-フィルター：プロトコルパラメータ 'key'に文字列が含まれているデータセットのみを読み取ります
'value'（ 'key = value'の形式で指定）

-fmap：メモリ使用量を減らすために、（生の）データを読み取った後もファイルマッピングを維持しますが、書き込みは行います
アレイに入れるとクラッシュします

-jdx：複数のJDXアレイが存在する場合は、これを選択します

-r方言：指定された形式の方言を使用してデータを読み取ります。 （デフォルトは方言なし）

-rf：フォーマットを読み取り、ファイル拡張子を上書きするために使用します（options = autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit、default = autodetect）

-スキップ：生データを読み取る前にこのバイト数をスキップします（デフォルト= 0）

File 書きます オプション：
-追加：生データの場合のみ、既存のファイルに追加します

-fnamepar：一意の作成時に含めるプロトコルパラメータのスペース区切りのリスト
ファイル名

-ノスケール：整数を格納するときに値を再スケーリングしないでください

-スプリット：プロトコルとデータのペアを別々のファイルに強制的に分割します。

型：画像表現タイプ（オプション=自動float double s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit、デフォルト=自動）

-w方言：指定された形式の方言を使用してデータを書き込みます。 （デフォルトは方言なし）

-wf：フォーマットを書き込み、ファイル拡張子を上書きするために使用します（options = autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit、default = autodetect）

-wp：プロトコルをこのファイルに個別に保存します。

フィルタ：
-整列 ：データをのジオメトリ（ボクセル位置）に位置合わせします
外部ファイル

-オートマスク ：自動ヒストグラムベースのしきい値を使用してマスクを作成する

-集まる ：サイズでソートされた、ゼロ以外の隣接/隣接ボクセルのクラスターを作成します

-畳み込み <convolution kernel (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp）、カーネル直径[mm]>：空間次元での畳み込み

-トレンド除去 <Number of low frequency components to be removed,Zero mean of resulting
タイムコース>：時間の経過とともに遅いドリフトを削除します

- 編集 <Position/range string in the format (timeframe,slicepos,phasepos,readpos),new value
of voxel>：単一のボクセル値を編集します

-ゲンマスク ：値を持つすべてのボクセルを含むマスクを作成します
与えられた範囲で

-等方性 ：補間によって画像ボクセルを等方性にする（画像
ジオメトリは変更されません）

-ローパス ：ローパスフィルタリング

-最大 ：最大値を超えるすべての値をクリップします

-マキシプ ：最大強度の投影を実行します
与えられた方向に

-マージ ：時間ディメンションを拡張して、データセットを単一のデータセットにマージします

-分 ：最小値より下のすべての値をクリップします

-ミニップ ：最小強度の投影を実行します
与えられた方向に

-noNaN ：すべてのNaNを指定された値に置き換えます

-pflip ：データを位相方向に反転します

-プランジ ：範囲を選択
位相方向

-プロジェクト ：与えられた以上の平均投影を実行します
方向

-クォンティルマスク ：指定された分数より上のすべてのボクセルを含むマスクを作成します
しきい値

-リサンプル ：画像データの一時的なサイズ変更

-サイズ変更 ：画像データの空間サイズ変更

-再スライス ：画像を特定のサイズに再スライスします
オリエンテーション

-rflip ：データを読み取り方向に反転します

-腐敗 ：面内回転

-レンジ ：範囲を選択
方向を読む

-規模 ：画像値を再スケーリングします

-スリップ ：データをスライス方向に反転します

-シフト <readDirection shift [pixel],phaseDirection shift [pixel],sliceDirection shift
[ピクセル]>：データを空間的にシフトする

-スライスタイム ：修正
スライスの異なる取得時点

-スプライス ：スプライス
与えられた方向の画像

-奇妙な ：範囲を選択
スライス方向

-swapdim <[rps] [-]、[rps] [-]、[rps] [-]>：方向を指定して寸法を入れ替え/反映する
オプションの反射記号が追加されたトリプル

-タイル ：スライスを組み合わせて正方形の2D画像にする

-トランジェ ：範囲を選択
時間方向

-tshift ：時間内にデータをシフト

-typemax ：特定のデータ型の最大値を超えるすべての値をクリップします

-typemin ：特定のデータ型の最小値より下のすべての値をクリップします

-usemask ：ファイルからマスク内のすべての値を含む1Dデータセットを作成します

その他 オプション：
-v またすべてのコンポーネントまたは単一のコンポーネントをデバッグ/トレースするため
それぞれコンポーネント。 loglevelに指定できる値は、0（noLog）、1（errorLog）、
2（warningLog）、3（infoLog）。

-h, - 助けて, -助けて, - バージョン ：ヘルプテキストまたはバージョン情報を印刷する

サポート file 拡張機能（フォーマット）：
3db（Iris3Dバイナリデータ）

分析します
（NIFTI / ANALYZE、方言：fsl）

asc（ASCII、方言：tcourse）

coi（JCAMP-DXデータセット）

dat（Matlab ascii 2Dデータマトリックス）

dcm（DICOM、方言：siemens）

double（double rawデータ）

float（float raw data）

gz（他の形式のGNU-Zipコンテナ）

hdr（ファイル間、方言：ニューロスタット）

hdr（NIFTI / ANALYZE、方言：fsl）

idx（3D-ASCIIの非ゼロのインデックス）

ima（DICOM、方言：siemens）

インターファイル
（ファイル間、方言：ニューロスタット）

jdx（JCAMP-DX画像形式）

mag（DICOM、方言：siemens）

mhd（MetaImage）

nii（NIFTI / ANALYZE、方言：fsl）

ph（DICOM、方言：siemens）

png（ポータブルネットワークグラフィックス）

pos（ASCIIでの非ゼロのxy位置）

プロ（ODIN測定プロトコル）

reg（Ansoft HFSS ASCII）

s16bit（署名された16ビットの生データ）

s32bit（署名された32ビットの生データ）

s8bit（署名された8ビットの生データ）

smp（JCAMP-DXデータセット）

u16bit（符号なし16ビットrawデータ）

u32bit（符号なし32ビットrawデータ）

u8bit（符号なし8ビットrawデータ）

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