これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド mirabait です。
プログラム：
NAME
mirabait - リードコレクションからリードを選択
SYNOPSIS
ミラベイト [-f ] [-t [-NS ...]] [-イクロール] ベイトファイル インファイル
DESCRIPTION
ミラベイト 部分的に類似または等しい読み取りコレクションから読み取りを選択します
ターゲットベイトとして定義されたシーケンス。 類似性は、ユーザーが調整可能な
餌で同じである一般的なk-mer（k個の連続した塩基の配列）の数
順方向または逆方向のいずれかで選択されるシーケンスおよびスクリーニングされたシーケンス
補完方向。
OPTIONS
-f
このタイプのプロジェクトファイルをロードします。fromtypeは次のとおりです。
CAF からの caf シーケンス
MAF からの maf 配列
PHD からの phd 配列
GBF からの gbf シーケンス
FASTA からの fasta 配列
FASTQ からの fastq シーケンス
-t
このタイプにシーケンスを書き込みます (複数の言及 -t 許可されています）：
fasta 配列から FASTA へ
fastq シーケンスから FASTQ へ
caf シーケンスから CAF へ
maf シーケンスから MAF へ
txt シーケンス名をテキスト ファイルに
-k k-mer、ベースでの餌の長さ (<32、デフォルト = 31)
-n 最小。 必要な k-mer ベイトの数 (デフォルト = 1)
-i 逆ヒット：ベイトにヒットしないシーケンスのみを書き込みます
-r 逆補完方向のチェックなし
-o fastq品質オフセット（ -f ='fastq'）FASTQの品質値のオフセット
ファイル。 デフォルト: 33 値 0 は、自動的に認識しようとします。
-f
このタイプのプロジェクトファイルをロードします。fromtypeは次のとおりです。
CAF からの caf シーケンス
MAF からの maf 配列
PHD からの phd 配列
GBF からの gbf シーケンス
FASTA からの fasta 配列
FASTQ からの fastq シーケンス
-t
このタイプにシーケンスを書き込みます (複数の言及 -t 許可されています）：
fasta 配列から FASTA へ
fastq シーケンスから FASTQ へ
caf シーケンスから CAF へ
maf シーケンスから MAF へ
txt シーケンス名をテキスト ファイルに
-k k-mer、ベースでの餌の長さ (<32、デフォルト = 31)
-n 最小。 必要な k-mer ベイトの数 (デフォルト = 1)
-i 逆ヒット：ベイトにヒットしないシーケンスのみを書き込みます
-r 逆補完方向のチェックなし
-o fastq品質オフセット（ -f ='fastq'）FASTQの品質値のオフセット
ファイル。 デフォルト: 33 値 0 は、自動的に認識しようとします。
onworks.net サービスを使用してオンラインでミラベイトを使用する
