これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド Polydote です。
プログラム:
NAME
Polydot - シーケンスセットの全対全比較のためのドットプロットを描画します
SYNOPSIS
ポリドット -シーケンス シーケンスセット -ワードサイズ 整数 -ギャップ 整数 [-ボックスイット boolean]
[-ダンプフィート トグル] -アウトフィート 偉業 -グラフ グラフ
ポリドット -助けて
DESCRIPTION
ポリドット EMBOSS(「EuropeanMolecular BiologyOpen」のコマンドラインプログラムです。
ソフトウェアスイート」)。 これは、「位置合わせ:ドット プロット」コマンド グループの一部です。
OPTIONS
入力
-シーケンス シーケンスセット
配列アライメントを含むファイル
必須
-ワードサイズ 整数
デフォルト値:6
出力
-ギャップ 整数
これは、個々のドットプロットを分離するために使用されるギャップのサイズを指定します。
ディスプレイ。 サイズは出力に表示されるように残基で測定されます。 デフォルト
値:10
-ボックスイット boolean
デフォルト値:Y
-ダンプフィート トグル
デフォルト値:N
-アウトフィート 偉業
-グラフ グラフ
onworks.net サービスを使用してオンラインで Polydote を使用する