これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの 2 つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド pymvpaXNUMX-dump です。
プログラム：
NAME
pymvpa2-dump - データセット コンポーネントを他の (ファイル) 形式にエクスポートします
SYNOPSIS
pymvpa2 ダンプ [- バージョン] [-h] -i データセット [データセット ...] [-s | --さ SA | --fa FA | --だ DA]
[-o 出力] [-f {hdf5,nifti,npy,txt}] [--マッパーデータセット データセット [データセット ...]]
[--hdf5-圧縮 タイプ]
DESCRIPTION
データセット コンポーネントをさまざまな形式でダンプする
単一の任意のデータセット コンポーネント (サンプル データ、サンプル属性、フィーチャ属性、
データセット属性）を選択して、別の形式にエクスポートできます。サポートされているリスト
形式とそれぞれの機能は以下のとおりです。
プレーンテキスト出力
1D および 2D の数値データをプレーンテキストとしてエクスポートできます。さらに、文字列のリストは次のとおりです。
もサポートされました。通常、データは 2D を除き、XNUMX 行に XNUMX つの要素でエクスポートされます。
数値行列。行全体が 1 行 (スペース区切り) に書き込まれます。
サポートされていないすべてのデータに対して警告が発行され、データのテキスト説明が切り詰められます。
データセットコンポーネントが与えられます。
HDF5ストレージ
HDF5 コンテナには任意のデータ (タイプ) を格納できます。ネイティブな単純なデータの場合
HDF5 によってサポートされるトップレベルの HDF5 データセットが作成され、すべてのデータが含まれます。複雑ではありません
ネイティブでサポートされるデータ型は、HDF5 に格納される前にシリアル化されます。
Numpy の NPY バイナリ ファイル
数値データ（任意の次元数）を格納するためのデータ形式です。
バイナリ形式）。
ニフティファイル
このデータ形式は、(多次元) 空間画像用です。入力データセットには
対応するデータセット コンポーネントを画像空間に逆マッピングできるマッパー。
OPTIONS
- バージョン
プログラムのバージョンとライセンス情報を表示して終了します
-h, - 助けて, --ヘルプ-np
このヘルプ メッセージを表示して終了します。 --ヘルプ-np ポケベルの使用を強制的に無効にします
ヘルプを表示するためのものです。
-i データセット [データセット ...]、 - 入力 データセット [データセット ...]
XNUMX つ以上の PyMVPA データセット ファイルへのパス。 すべてのデータセットは XNUMX つにマージされます。
単一のデータセット (vstack 化) を指定順に並べます。 場合によっては、このオプションは
複数の個別の入力データセットが存在する場合は、複数回指定する必要があります。
必要。
-o 出力、 - 出力 出力
出力ファイル名。出力ファイル名が指定されていない場合、出力は stdout に送られます。
データ形式で許可されている場合
-f {hdf5,nifti,npy,txt}, - フォーマット {hdf5,nifti,npy,txt}
出力フォーマット
--マッパーデータセット データセット [データセット ...]
逆マッピング機能にマッパーを使用する必要がある PyMVPA データセットへのパス
NIfTI エクスポート用に体積空間に変換します。デフォルトでは、入力データセット内のマッパー
使用されている。
オプション の 選択 データセット コンポーネント：
-s, --サンプル
データセットのサンプルをダンプします。
--さ SA
ダンプされるサンプル属性の名前。
--fa FA
ダンプするフィーチャ属性の名前。
--だ DA
ダンプするデータセット属性の名前。
オプション の HDF5 出力：
--hdf5-圧縮 タイプ
HDF5 ストレージの圧縮タイプ。 使用可能な値は特定の HDF5 によって異なります
インストール。 一般的な値は、「gzip」、「lzf」、「szip」、または 1 ～ 9 の整数です。
gzip 圧縮レベルを示します。
例
サンプル属性を出力する
$ pymvpa2 dump -i mydata.hdf5 --sa subj
サンプル データ配列を NumPy の .npy 形式にエクスポートします。
$ pymvpa2 dump -i mydata.hdf5 -s -f npy -d mysamples.npy
onworks.net サービスを使用してオンラインで pymvpa2-dump を使用する
