これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドスーパーマッチャーです。
プログラム：
NAME
スーパーマッチャー-より大きな配列のおおよそのローカルペアワイズアラインメントを計算します
SYNOPSIS
スーパーマッチャー -シーケンス セコール -bシーケンス シーケンスセット [-データファイル マトリックス] [-ミンスコア フロート]
-ギャップペン フロート -gapextend フロート [-幅 整数] [-ワードレン 整数]
-outfile 整列する [-エラーファイル アウトファイル]
スーパーマッチャー -助けて
DESCRIPTION
スーパーマッチャー EMBOSS（「EuropeanMolecular BiologyOpen」のコマンドラインプログラムです。
ソフトウェアスイート」）。 これは、「Alignment：Local」コマンドグループの一部です。
OPTIONS
入力
-シーケンス セコール
-bシーケンス シーケンスセット
-データファイル マトリックス
これは、シーケンスを比較するときに使用されるスコアリングマトリックスファイルです。 デフォルトでは、
ファイル「EBLOSUM62」（タンパク質の場合）またはファイル「EDNAFULL」（核酸配列の場合）。 これらは
ファイルは、EMBOSSインストールの「data」ディレクトリにあります。
-ミンスコア フロート
アラインメントを報告するための最小アラインメントスコア。
必須
-ギャップペン フロート
デフォルト値：@（$（acdprotein）？10.0：10.0）
-gapextend フロート
デフォルト値：@（$（acdprotein）？0.5：0.5）
NEW
-幅 整数
デフォルト値：16
-ワードレン 整数
デフォルト値：6
出力
-outfile 整列する
-エラーファイル アウトファイル
失敗したアライメントに対して書き込まれるエラーファイルデフォルト値：supermatcher.error
onworks.netサービスを使用してオンラインでsupermatchereを使用する
