これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド xtractore です。
プログラム:
NAME
xtractore - 指定されたシーケンスからアノテーション付きの特徴に対応するシーケンスを抽出します
file
SYNOPSIS
エクストラクタ [オプション] 機能.gff3 シーケンス.ファスタ
DESCRIPTION
オプション:
-d|--デバッグ
デバッグ出力を印刷する
-h|-ヘルプ
このヘルプメッセージを印刷して終了します
-i|--idfile: ファイル
機能 ID のリストを含むファイル (スペースなしで 1 行に XNUMX つ)。 提供されている場合、
このファイル内の ID を持つフィーチャのみが抽出されます
-o|--outfile: ファイル
出力シーケンスが書き込まれるファイル。 デフォルトはターミナル(標準出力)です
-t|--タイプ: STRING
抽出する特徴タイプ。 複数の特徴を抽出するために複数回使用できます。
-v|--バージョン
バージョン番号を出力して終了します
-V|-詳細
詳細な警告メッセージとエラーメッセージを出力する
-w|--幅: INT
Fasta 出力のシーケンスの各行の幅。 デフォルトは 80 です。 いいえの場合は 0 に設定します
書式設定
onworks.net サービスを使用して xtractore オンラインを使用する