これは、最新リリースがadoma-1.0.tar.gzとしてダウンロードできるADOMAという名前のLinuxアプリです。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
OnWorksを使用してADOMAという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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ADOMA
DESCRIPTION
ADOMAの略:マルチプルアラインメントの代替表示。 ADOMAは、マルチプルアラインメントのXNUMXつの異なる表示を作成できます。HTML形式のClustalWアラインメント、HTMLおよび/またはtxt形式の簡略化されたClustalWアラインメント、およびHTML形式の色付きClustalWアラインメントです。 これらの出力ファイルの例については、スクリーンショットを確認してください。 ADOMAはClustalWを使用して、DNAまたはタンパク質配列からマルチプルアラインメントを作成し、ClustalWの通常の出力とはわずかに異なる表示をします。 ADOMAは、パイプラインで簡単に使用できるコマンドラインプログラムです。
詳細については、「ファイル」セクションのREADME.mdを確認してください。
ADOMAの引用方法:
Zaal、D。and Nota、B。(2016)、ADOMA:ClustalWマルチプルアラインメント出力を変更するためのコマンドラインツール。 モル。 Inf。、35:42–44。 土井:10.1002 / minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
Unixシェル、Python
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/adoma/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。