これは、Linux オンラインで実行する AMBIENT という名前の Linux アプリで、その最新リリースはambient-1.3.tar.gz としてダウンロードできます。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
AMBIENT という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux オンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linux オンラインで実行するための AMBIENT
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DESCRIPTION
重要：BMC Sys BioでのAMBIENTメソッドの公開以来、いくつかの更新が行われました。 ペーパーで使用されているバージョンを使用する場合はv0.6.3ですが、同じように機能するが、追加のオプションがあり、安定性とパフォーマンスが向上している最新バージョンを使用することをお勧めします。 ご関心をお寄せいただきありがとうございます。AMBIENT（二部ネットワーク用のアクティブモジュール）は、シミュレーテッドアニーリングを使用して、一貫した特性を持つ代謝ネットワーク（モジュール）の領域を見つけるPythonモジュールです。 AMBIENTは事前定義された経路を必要とせず、代謝の影響を受ける領域の非常に具体的な予測を提供します。
たとえば、注釈付きのコード化遺伝子の転写データに基づく反応のスコアをネットワークで使用でき、協調的な発現変化のモジュールを見つけることができます。 これは、経路/遺伝子セット濃縮分析の代替手段を提供し、同時により柔軟でより具体的です。
Audience
科学/研究
プログラミング言語
Python
これは、https：//sourceforge.net/projects/ambient-bio/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
