これはAutoprimeという名前のLinuxアプリで、最新リリースはautoprime.2.1.tar.gzとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
Autoprime withOnWorksという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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オートプライム
DESCRIPTION
AutoPrimeを使用すると、真核生物の発現をリアルタイムPCRで測定するためのプライマーを迅速に設計できます。
EnsEMBLデータベースに接続することにより、遺伝子構造情報を使用して、エクソンの境界にまたがるプライマーを見つけることができます。 このようにして、発現された配列のみがキャプチャされます。 さらに、RepBaseからの情報を使用して、反復領域でのミスプライミングを回避できます。
特徴
- 自動プライマー設計
- 詳細設定による品質管理
- よく知られたソースの使用:Primer3、EnsEMBL、RepBase
- 2003年以降のプライマーの作成
- サービスとして実行されているWebサイト
- ローカル実行に利用可能なPerlコード
Audience
科学/研究、上級エンドユーザー
ユーザーインターフェース
Webベースのコマンドライン
プログラミング言語
パール
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/autoprime/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。