これは bspipe という名前の Linux アプリで、最新リリースは bspipe-1.3.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
OnWorks を使用して、bspipe という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
ビーパイプ
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DESCRIPTION
BSpipe は、配列の品質管理とマッピングから、差次的にメチル化された領域の機能解析までの包括的なパイプラインです。
(1) シーケンスの品質評価、
(2) シーケンス洗浄、
(3) シーケンスリードマッピング、
(4) メチル化の定量化、
(4) メチル化プロファイルに基づくサンプルの比較、
(5) DMR (示差的にメチル化された領域) の同定、
(6) DMR のアノテーション、
(7) 異なるメチル化遺伝子の機能解析、
(8) 視覚化のための入力ファイルの生成、および
(9) TAB-seq、OxBS-seq、MAP-it、NOMe-seq などの高度なシーケンス技術のサポート。
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
Unix シェル、Perl、S/R
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/bspipe/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。