これはCalis-pという名前のLinuxアプリで、最新リリースはCalisp-2.1.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
Calis-pという名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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カリス-P
DESCRIPTION
Calis-p（プロテオミクスにおける同位体へのCALgaryアプローチ）は、プロテオミクスデータセットから微生物群集の個々の種の同位体組成（たとえば、delta13Cまたはdelta15N）を推定するJavaアプリケーションです。 Calis-p 2.0は、天然の同位体存在量と、安定同位体プロービング（SIP）などのラベリング実験からのデータの両方を処理します。 入力としてmzIdent（またはターゲットスペクトルの一致）とmzMLファイルが必要であり、1スレッドのmzMLファイルごとに約10分必要であり、10Gb未満のRAMが必要です。 さまざまなナノ液体クロマトグラフィー/ Orbitrapプラットフォームからのデータでテストされています。 SIPを成功させるには、非常に感度が高くなりますが、13Cの割合を10％未満に保つ必要があります。
オプション
- delta13Cは、標準のメタプロテオミクスデータセットから推定されます
- 微生物叢サンプル中の多くの種のdelta13Cを効率的かつ確実に取得します。
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/calis-p/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
