これはFOCUSという名前のLinuxアプリで、最新リリースはFOCUS_0.31_python_2.7.XX.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
OnWorksでFOCUSという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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FOCUS
DESCRIPTION
FOCUSは、非負の最小二乗法を使用して、メタゲノムサンプルに存在する豊富な生物とシーケンス長に依存しない相対的な豊富さをプロファイリングおよびレポートすることに基づく革新的で機敏な構成です。 プログラムはシミュレートされた実際のメタゲノムでテストされ、その結果は、私たちのアプローチがランダムなコミュニティの生物を予測することを示しています。可用性と実装：Pythonで実装されたコードは、こことWebサーバーにあります。 http://edwards.sdsu.edu/FOCUS.
依存関係：クラゲ、Numpy、Scipy。
FOCUSを引用
Silva、GGZ、DA Cuevas、BE Dutilh、およびRA Edwards、2014年：FOCUS：非負の最小二乗を使用してメタゲノム内の生物を識別するためのアライメントフリーモデル。 PeerJ、2、e425、doi：10.7717/peerj.425。
特徴
- メタゲノム
- 豊かさ
- 抽出の均一性
これは、https：//sourceforge.net/projects/metagenomefocus/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
