これは HyLiTE という名前の Linux アプリで、最新リリースは HyLiTE-2.0.2-py3-none-any.whl としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
HyLiTE with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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ハイライト
DESCRIPTION
HyLiTE（Hybrid Lineage Transcriptome Explorer）は、同種倍数体種からのハイスループットトランスクリプトームデータを分析します。
同種倍数性は、XNUMXつ以上の異なる親の結合からの新しい雑種生物の形成を説明します。 同種倍数体種は、各遺伝子の複数のコピー（ホメオログ）を持っており、これらはしばしば異常な発現パターンを示します。 ホメオログの発現レベルは、技術的には次世代シーケンシングデータ（RNA-seq）から決定できますが、実際には、特に全ゲノムスケールで、あるホメオログにリードを割り当てることは非常に困難です。 HyLiTEはこのプロセスを自動化し、非常に複雑な異質倍数体種でも遺伝子発現パターンを調べることができます。
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
Python
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/hylite/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
