これは、In silico フラグメンテーション評価という名前の Linux アプリで、最新リリースは input.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
OnWorks による In silico フラグメンテーション評価という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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インシリコでの断片化評価
DESCRIPTION
私たちは、代謝産物の構造解明に役立つ XNUMX つの公的に利用可能な in silico フラグメンテーション ツール (MetFrag、CFM-ID、MAGMa+、および MS-FINDER) のパフォーマンスを比較しました。
これらのツールの出力を使用して、候補ファイルを結合、並べ替え、再ランク付けし、正解率を高める投票/コンセンサス モデルを開発しました。
520 CASMI チャレンジからの 2016 化合物を使用し、トレーニング用に 312 化合物、検証目的に 208 化合物を使用しました。
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/in-silico-fragmentation/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。