これは、Linux でオンラインで実行する iPiG という名前の Linux アプリで、最新リリースは ipig_r5.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
iPiG という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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オンラインの Linux で iPiG を実行する
DESCRIPTION
iPiG は、質量分析 (MS) からのペプチド スペクトル一致 (PSM) の統合をターゲットとしています。UCSC ゲノムブラウザ (http://genome.ucsc.edu/).
iPiG は、MS 標準形式 mzIdentML (*.mzid) またはテキスト形式から PSM を取得し、結果をゲノム トラック形式 (BED および GFF3 ファイル) で提供します。これは、ゲノム ブラウザーに簡単にインポートできます。
iPiG とその機能の詳細については、以下を参照してください。
「iPiG: ペプチドスペクトルの一致をゲノムブラウザー視覚化に統合」
マティアス・クーリングとベルンハルト・Y・レナード
(http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0050246)
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
Java Swing、コンソール/ターミナル
プログラミング言語
Java
これは、https://sourceforge.net/projects/ipig/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。