これは、MetaPhat -meta-pheno-association-tracker という名前の Linux アプリで、最新リリースは meta_phat.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
MetaPhat -meta-pheno-association-tracker という名前のこのアプリを OnWorks で無料でオンラインでダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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MetaPhat -メタフェノ関連トラッカー
DESCRIPTION
MetaPhat は、単変量 GWAS 研究からの要約統計量を使用して、多変量関連性のあるバリアントを検出するアクティブなオープンソース (MIT ライセンス) ツールです。 このアプリケーションは、多変量リード バリアントの最適な BIC サブセットと P 値ドライバー特性を見つけることによって分解も実行します。 変異の結果は追跡され、クラスター化され、表現型と遺伝子型の関係を分析するのに役立ちます。インストール手順、必要な GWAS データ形式、テスト コマンドでの入力例については、Wiki ホームを参照してください。 https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
グローバル脂質 (GLGC、Willer 2013) データ/ソース タールの例 - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
サンプルを試してチュートリアルを読んだ後に問題が発生した場合、または機能リクエストがある場合は、次のメールアドレスまでご連絡ください。 [メール保護]
著作権 <2019> [メール保護], [メール保護]
特徴
- 多変量ゲノムワイド形質解析
- p値とBICに基づく最適な形質サブセットの選択
- 特性分解トレースプロット
- リード SNP およびドライバー特性概要ファイル
- snp-snp 特性ランク スピアマン クラスター
これは、https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
