これは Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) という名前の Linux アプリで、最新リリースは ODDT0.7.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) という名前のこのアプリを OnWorks で無料でオンラインでダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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オープン創薬ツールキット (ODDT)
DESCRIPTION
Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) は、ケモインフォマティクス、分子モデリングなどで使用するためのモジュール式の包括的なツールキットです。ODDT は Python で書かれており、Numpy/Scipy を広範囲に使用します。 共通 API の下で統合されたサポートされているツールキットを使用できます (参照については、Pybel または Cinfony を参照してください)。 Pybel/Cinfony に基づくすべてのメソッドとソフトウェアは、ODDT ツールキットとドロップイン互換性がある必要があります。 最小限の API を目的とした以前のバージョンとは対照的に、ODDT では拡張メソッドと追加のハンドルが導入されています。 これらの拡張機能を使用すると、ツールキットを最大限に使用できるようになり、一部の機能が他の機能からバックポートされて不足している機能が追加される場合があります。 ODDT における Molecule の最も重要で便利なプロパティは、指定された分子のほとんどのプロパティを含む Numpy 辞書です。 それらの中には簡単なものもあれば、何らかの計算が必要なものもあります。 原子の特徴。 分子の主要なエンティティについては辞書が提供されています。
オプション
- 主要なエンティティの辞書が提供されています
- 主な利点は、素晴らしい Numpy ブロードキャストとサブセット化です。
- 各辞書はNumpyのフォーマットとして定義されています。
- XNUMX つの分子間の相互作用が計算され、フィンガープリントに保存されます
- 分子間の相互作用を確認する
- 共通の API の下で統合されたサポートされているツールキットを使用できます
プログラミング言語
Python
カテゴリー
これは https://sourceforge.net/projects/oddt.mirror/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
