これは、Linux でオンラインで実行する OptimizeSNP という名前の Linux アプリで、最新リリースは Optimize1.0code.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
OptimizeSNP という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linux でオンラインで実行するために SNP を最適化する
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DESCRIPTION
プログラムは線形計画法を適用して、予測される発現 SNP の大部分をカバーするために実行する必要があるマイクロアレイとハイブリダイゼーション実験の数を最小限に抑えます。 1) mampl.exe がシステム PATH に存在する必要があります。 2) CPLEX 12.2 がインストールされている必要があります。 cplexamp.exe はシステム PATH に存在する必要がありますmampl.exe は、AMPL を含む任意のプログラムから入手できます。 MOSEK の試用版から AMPL を入手しました。 http://www.mosek.com/。 CPLEX 12.0 は次から入手できます。 http://www-01.ibm.com/software/integration/optimization/cplex-optimizer/。 IBM アカデミック・イニシアティブ申請書に記入することで、無料のアカデミック・ライセンスを取得できます。
Audience
科学/研究
プログラミング言語
パール
データベース環境
フラットファイル
これは、https://sourceforge.net/projects/optimizesnp/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
