これは PARSEC - PAtteRn SEarch / Context という名前の Linux アプリで、最新リリースは PARSEC_Deployment_Package_v2.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
PARSEC - PAtteRn SEarch / Context with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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PARSEC - パターン検索/コンテキスト
DESCRIPTION
ゲノム部位の特徴付けは、次世代シーケンス データの理解と活用における大きな課題です。 ほとんどのゲノム部位は、散在した分布を持つ短い縮退モチーフによって表され、場合によっては生物学的機能 (例: 遺伝子発現の制御、スプライシング パターン、エピジェネティクス シグナル) を伴います。 これらのモチーフには膨大な量のノイズが伴うため、ゲノム部位を正確に検出するための計算プラットフォームの開発には、偽陽性を除外するためにさまざまな大規模な生物学的データを統合する必要があります。
PARSEC は、ユーザーフレンドリーな環境で生物学的部位の非線形位置特定と特性評価を実行するために、多くの多様なゲノム情報を効率的に統合するための直感的でモジュール式 (簡単に拡張可能) のオールインワン ソリューションを表します。
ハードウェア要件とサポートされているブラウザについては、Wiki を参照してください。
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
ウェブベースの
プログラミング言語
C ++、Java
データベース環境
JDBC、MySQL、PostgreSQL（pgsql）
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
