これは PathMEN という名前の Linux アプリで、最新リリースは PathMen.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
PathMEN with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
パスMEN
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DESCRIPTION
PathNER は、生物医学文献から特定の経路に関する言及を特定するためのツールです。 PathNER は、GATE 組み込みフレームワークに基づいて構築されており、ソフト辞書照合とルールベースの検出に基づいています。 辞書は ConsensusPathDB と Pathway Ontology から生成され、ルールは JAPE で実装されます。 PathNER を使用すると、情報を提供するパスウェイ名 (例: 「Wnt パスウェイ」) の出現をすべて識別できます。 PathNER は、疾患と経路の関連性を明らかにすることを目的とした研究を支援するために使用できます。
Audience
科学/研究
プログラミング言語
Java
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/pathmen/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
