これは、QuRe_v0.99971.zip としてダウンロードできる最新リリースの qure という名前の Linux アプリです。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
onWorksでqureという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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キュア
DESCRIPTION
QuReは、ウイルスの準種再構築のためのプログラムであり、特にロングリード（> 100 bp）NGSデータを分析するために開発されました。 このソフトウェアは、リファレンスゲノムに対して配列フラグメントのアラインメントを実行し、カバレッジと多様性に基づいてゲノムのスライディングウィンドウへの最適な分割を見つけ、ヒューリスティックを使用してウイルス準種のすべての個々の配列をそれらの有病率とともに再構築しようとしますアルゴリズム。ゲノム分割全体で重複する別個のウイルス変異体の多項分布に一致します。 QuReには、組み込みのポアソンエラー訂正方法と再構成後の確率的クラスタリングが付属しており、どちらもホモポリマー領域と非ホモポリマー領域の特定のエラー率に基づいてパラメーター化されています。これは、https：//sourceforge.net/projects/qure/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
