これは、Linux オンラインで実行するための RNAseqR という名前の Linux アプリで、その最新リリースは RNAseqR_1.1.tar.gz としてダウンロードできます。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
RNAseqR という名前のこのアプリをダウンロードしてオンラインで実行し、OnWorks を使用して Linux オンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linuxオンラインで実行するRNAseqR
DESCRIPTION
RNAseqRは、RNA-seqデータの発現解析用に設計されており、複製されていない複数のライブラリーの解析に最適です。 これは、現在Linuxシステム用にコンパイルされているC ++コード化プログラムです。GUIおよびコマンドラインインターフェイスを使用すると、ログ、PPM、および/またはRPKM（長さが指定されている場合）変換、および負の二項累積分布関数（CDF）またはR検定統計量を使用した微分式の統計分析を実行できます。 StekelらによるEST分析のために導入されました。
出力により、CDF確率、上位R値、またはR値とランダム化データとの比較に基づいた決定が可能になります。 比較は、Stekel et alの信憑性メトリック、または特定の平均式で観測されたRと期待されるRです。 ランダム化は、ポアソン分布または負の二項分布、または列のシャッフルによって行われます。
プログラミング言語
C + +
これは、https：//sourceforge.net/projects/rnaseqr/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
