これは SeqSelector という名前の Linux アプリで、最新リリースは SeqSelector1.1b.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
SeqSelector with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
シーケンスセレクター
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DESCRIPTION
SeqSelector ツールセットは、ユーザーフレンドリーでプラットフォームに依存しない Python スクリプト スイートで、ハイブリダイゼーション ベースの配列キャプチャを通じて、次世代ライブラリーのターゲットを絞った濃縮のための配列の選択を容易にします。 スクリプトはプログラミングの知識を必要とせず、モデルまたは非モデル種のゲノム配列に適用できます。 私たちは、以前の研究と機能遺伝子アノテーションの公的に利用可能なデータセットから目的の遺伝子を最初に特定するワークフローを提案します。 候補遺伝子のリストが特定されると、それらの配列が参照ゲノムから選択されます。 これらの配列は、非モデル種のアノテーションのないゲノムの BLAST 検索中にクエリとして使用され、対応する配列が返されます。これは、ハイブリダイゼーションベースの配列捕捉用のベイトの設計に使用できます。
プログラミング言語
Python
カテゴリー
これは https://sourceforge.net/projects/seqselector/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。