これはSUPERmergeという名前のLinuxアプリで、最新リリースはSUPERmerge.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
SUPERmerge withOnWorksという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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スーパーマージ
DESCRIPTION
SUPERmergeは、ChIP-seqリードパイルアップ分析およびアノテーションアルゴリズムであり、単一の塩基対の解像度レベルで幅広いクロマチンドメインを持つ拡散ヒストン修飾ChIP-seqデータセットのアラインメント(BAM)ファイルを調査します。 SUPERmergeを使用すると、さまざまなリードパイルアップパラメーターを柔軟に調整できるため、リードアイランドがゲノム全体のカバレッジ領域にどのように集約され、個々の生物学的複製内でどのアノテーション機能にマッピングされるかが明らかになります。 SUPERmergeは、エピジェネティックなヒストン修飾(H3K9me1、H3K27me3など)が複数の連続するゲノム遺伝子座と注釈付きの特徴にまたがる拡散範囲のシグナル濃縮を伴う本質的に広いピークをもたらす、サンプルサイズの小さいChIP-seq実験の調査に特に役立ちます。
特徴
- チップ seq
- エピジェネティックス
- バイオインフォマティクス
- 計算生物学
Audience
科学/研究
プログラミング言語
C
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/supermerge/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。