これは、Linux オンラインで実行する VDJFasta という名前の Linux アプリで、その最新リリースは vdjfasta-1.1.2.tgz としてダウンロードできます。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
VDJFasta という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux オンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linuxオンラインで実行するVDJFasta
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DESCRIPTION
抗体可変ドメイン レパートリーの分析のためのバイオインフォマティクス Perl 拡張。 Sanger または 454 シーケンシングのいずれかによって取得された哺乳類のレパートリー シーケンスに適しています。 Glanville、Zhai、Berka ら、PNAS 2009 で公開された方法。オプション
- HMM ベースの CDR 識別
- HMM ベースの翻訳と配置
- 確率的生殖細胞分類
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コンソール/ターミナル
プログラミング言語
パール
https://sourceforge.net/projects/vdjfasta/ からも取得できるアプリケーションです。 これは、OnWorks でホストされており、無料のオペレーティング システムの XNUMX つからオンラインで簡単に実行できます。
