これは ART-DeCo という名前の Windows アプリで、最新リリースは ART-DeCo.tar.gz としてダウンロードできます。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
ART-DeCo with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショットは
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DESCRIPTION
ART-DeCo (Allelic Ratio based Tool for Detection of Contamination) は、構成的 NGS 分析でコンタミネーションを検出するように設計されています。 このツールは、対象領域内でシーケンスされた一塩基多型 (SNP) の対立遺伝子比 (AR) を使用します。 サンプルが異なる遺伝子型の DNA で汚染されている場合、予期しない AR が得られます。 それらは、スクリーニングテストで汚染の検出に使用され、その後、汚染物質の識別と定量化。
ART-DeCo は、遺伝子パネルからゲノム全体の解析まで、あらゆる NGS ワークフローに実装できます。
どんなポリモーフィズムも役に立ちます。 まれな SNP および連鎖不平衡の SNP は、予測される汚染を統合するために考慮に入れる必要があります。
これは https://sourceforge.net/projects/ngs-art-deco/ からも取得できるアプリケーションです。 これは、OnWorks でホストされており、無料のオペレーティング システムの XNUMX つからオンラインで簡単に実行できます。
