これは CupidTool という名前の Windows アプリで、最新リリースは 3PrimeUTR_20491transcripts_18093genes.txt.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
OnWorksでCupidToolという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
キューピッドツール
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DESCRIPTION
ちうらal。、Genome Research 2014キューピッドは、miRNA-ターゲット相互作用とそれらを介した競合的内因性RNA(ceRNA)相互作用を同時に予測する方法です。
乳がん細胞株のmRNAレベルとタンパク質レベルの両方の測定によって評価されるように、統合的アプローチによってmiRNAターゲットの予測精度が大幅に向上することを示しました。
キューピッドは3つのステップで実装されます:
ステップ1:TargetScan、miRanda、およびPITAによって推測されるように、3'UTR内の候補miRNA結合部位を、それらのスコア、3' UTR内の位置、および異種間保存を統合することによって再評価します。
ステップ2:相互作用は、選択されたサイト、それらの多様性、およびmiRNAの発現プロファイルと推定ターゲット間の統計的依存性に関する情報を統合することによって予測されます。 各予測機能の尤度は、正のゴールドスタンダードセットに基づいて計算されます。
ステップ3:キューピッドは、推定されたターゲットが予測されたmiRNAレギュレーターと競合するかどうかを評価します。
Audience
ヘルスケア産業、科学/研究、工学
プログラミング言語
マトラブ
これは、https://sourceforge.net/projects/cupidtool/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
