これは、Linux経由でWindows上でオンラインで実行できるFishingCNVというWindowsアプリです。最新リリースはFishingCNV_1.5.3.zipとしてダウンロードできます。ワークステーション向けの無料ホスティングプロバイダーであるOnWorksでオンラインで実行できます。
OnWorks を使用して、FishingCNV というこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行し、Linux 経由で Windows でオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショットは
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FishingCNV は Linux オンラインで Windows オンラインで実行できます
DESCRIPTION
マギル大学で開発されたソフトウェア ツールである FishingCNV は、ハイスループット エクソーム シーケンス データにおけるまれなコピー数の変動を包括的に分析するためのツールです。 入力は Genome Analysis ToolKit (GATK) によって生成された標準カバレッジ ファイルで、出力は推定 CNV を含むファイルです。プログラムには 2 つの異なるリリースがあります
※GUI版（FishingCNV_X.XXzip）
※コマンドライン版（FishingCNV_X.X_pipeline）
ファイルを参照して、さまざまなリリースを見つけてください。
オプション
- グラフィカル・ユーザー・インタフェース
- 対応する検査/対照 (癌/腫瘍など) の CNV 分析
- 一致しないサンプルの CNV 分析
- コントロールセット内のバッチ効果の削除
- タブ区切りの出力は Excel で表示できます
- 追加の出力ファイルはIGVで視覚化できます
- 各染色体の分布プロットと外れ値プロット
Audience
科学/研究、教育
ユーザーインターフェース
Java Swing
プログラミング言語
Java、S / R
これは、https://sourceforge.net/projects/fishingcnv/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
