これはNGSEPという名前のWindowsアプリで、最新リリースはNGSEPwindows_4.1.0.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
OnWorksでNGSEPという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショットは
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NGSEP
DESCRIPTION
NGSEPは、DNAハイスループットシーケンスデータを分析するための統合フレームワークです。 NGSEPの主な用途は、ゲノム変異の大規模なデータセットの構築とダウンストリーム分析です。 NGSEPは、一塩基多型（SNV）、大小のインデル、短いタンデムリピート（STR）、逆位、およびコピー数多型（CNV）の正確な検出と遺伝子型決定を実行します。 NGSEPは、機能アノテーション、フィルタリング、フォーマット変換、比較、クラスタリング、代入、遺伝子移入分析、およびさまざまな種類の統計のためのモジュールも提供します。 機能の完全なリストは、ウィキ（https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
ニュース：de-novoゲノムアセンブラーの最初のバージョンが利用可能になりました。 詳細については、wikiを参照してください。
特徴
- De-novoゲノムアセンブリ
- 生のリードのリファレンスゲノムへのアラインメント
- SNP、CNVおよび構造変異体の検出
- VCF操作：機能アノテーション、マージ、フィルター、比較、フォーマット変換、代入
- 逆多重化を読み取ります
- 注釈付きゲノムアセンブリのアラインメント
- GFF3形式のトランスクリプトームアンプテーションの統計とフィルタリング
Audience
ヘルスケア産業、科学/研究、その他の対象者、農業
ユーザーインターフェース
Java SWT、コンソール/ターミナル、Eclipse
プログラミング言語
Java
これは、https：//sourceforge.net/projects/ngsep/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
