これは、Linux オンライン上で Windows オンラインで実行される NOFI ランキングという名前の Windows アプリで、最新リリースは NOFI-ranking_v1.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
NOFI ランキングという名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用してオンライン Linux 上で Windows オンラインで無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
NOFI ランキングは、オンライン Linux よりも Windows オンラインで実行される
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DESCRIPTION
NOFI ランキング アルゴリズムは、干渉の影響を受けたフラグメント イオンに低い優先順位を割り当てるように開発されました。 実装はカスタマイズ可能な R スクリプトです。 将来のバージョンにはモジュラー バージョンが含まれる予定です。 概要は次のとおりです。1) 入力には、Skyline や OpenSWATH などのソフトウェア ツールによって同定および定量されたペプチドからの SWATH フラグメント イオン XIC のリストが含まれます。
2) NOFI の最初のステップは、各フラグメント イオンをベクトルとして表すために使用される 4 つの属性 (RTd、FWHMd、IRd、および IRrep) を計算することです。
3) 多変量外れ値検出技術を使用して、各ペプチドのすべてのフラグメントイオンをランク付けします。
4) さまざまなインジケーターに対するトップ N フラグメント イオンの効果を視覚化するために、いくつかの図が生成されます (PDF ファイル)。
5) ユーザーはペプチドあたりの上位フラグメント イオンの数を選択できるため、障害のあるフラグメント イオンを除外しながら、優先度の高い Top-N NOFI の最適なサブセットを定量に利用できます。
Audience
科学/研究
プログラミング言語
S / R
これは https://sourceforge.net/projects/nofiranking/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
