これはScaffold_Builderという名前のWindowsアプリで、最新リリースはscaffold_builder_v2.2.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
Scaffold_Builderという名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショットは
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足場ビルダー
DESCRIPTION
Scaffold_builderは、参照シーケンスに沿ったドラフトシーケンスによって生成されたコンティグを順序付けるソフトウェアです。 ギャップはNで埋められ、小さなオーバーラップはニードルマン-ブンシュアルゴリズムとIUPACコードで作成されたコンセンサスに合わせられます。 Scaffold_builderは、欠落しているものを明らかにし、ターゲットを絞ったシーケンスによってそれらのギャップを埋めることができるようにすることで、ゲノムのアセンブリとアノテーションを支援します。（c）Silva GG、Dutilh BE、Matthews TD、Elkins K、Schmieder R、Dinsdale EA、Edwards RA
引用してください：「Denovoおよびリファレンスガイド付きアセンブリとScaffold_builderの組み合わせ」、Biology and Medicine2013のソースコード。
特徴
- 足場
- ドラフトゲノム
- バイオインフォマティクス
ユーザーインターフェース
Webベースのコマンドライン
プログラミング言語
Python
これは、https：//sourceforge.net/projects/scaffold-b/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
