Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 autodocktools 명령입니다.
프로그램:
이름
adt - AutoDock을 위한 그래픽 프런트 엔드인 AutoDockTools
개요
runAdt [옵션]
기술
이 매뉴얼 페이지는 에서 제공하는 출력을 거의 문자 그대로 번역한 것입니다. runAdt -h
명령.
옵션
아래에 옵션 요약이 포함되어 있습니다. 전체 설명은 다음을 참조하십시오.
온라인에서 사용할 수 있는 자습서 및 설명서.
-시간, --도움
옵션 요약을 표시합니다.
-a or --다시
마지막 로그 파일 재생
--overwrite로그
로그 파일 덮어쓰기
--고유로그
고유한 이름으로 로그 파일 생성
--로그 없음
로깅 끄기
--noSplash
시작 화면 끄기
--주사위 GUI 이벤트 루프를 시작하지 마십시오
--커스터마이저 파일
사용자 지정 파일 실행
--lib 패키지 이름
명령 라이브러리 추가
-v r, --전망 운영
명령줄에서 비전 네트워크 실행
-v o, --전망 일단
비전 네트워크 실행 및 ADT 종료
-d or --dmode 모드
표시 모드 지정
모드는 디스플레이 모드의 조합일 수 있습니다.
'cpk' : cpk
'선': 선
's' : 보조 구조 리본
'b' : 막대기와 공
'lic' : 감초
'ms' : 분자 표면
'ca' : C-알파 추적
'bt' : 백본 추적
'sp' : CA 스플라인
'sssb': 단백질의 XNUMX차 구조, 스틱 및 볼
결합이 없는 다른 잔기에 대한 결합선이 있는 다른 잔기
-c or --cmode 모드
표시 모드 색 구성표 지정:
'ca' : 원자별 색상
'cr' : 잔류물별 색상(RASMOL 방식)
'cc' : 체인별 색상
'cm' : 분자별 색상
'cdg': David Goodsell의 계획을 사용한 색상
'cs' : Shapely 구성표를 사용한 색상 잔여물
'css': XNUMX차 구조 요소별 색상
예 :
단백질을 리본으로, 비단백질을 막대기와 볼로 표시하고 원자 유형별로 색상을 표시합니다.
adt -i --dmode sssb --cmode cr myprot.pdb
adt -i -m sssb -c cr myprot.pdb
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인에서 autodocktools 사용
