Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 bp_sreformatp 명령입니다.
프로그램:
이름
bpsreformat - 시퀀스 형식 변환
기술
이 스크립트는 시퀀스 형식의 변환을 허용하는 SeqIO 시스템을 사용합니다.
서열 데이터 또는 다중 서열 정렬 데이터. 이름은 Sean이라는 사실에서 유래되었습니다.
Eddy의 프로그램 sreformat(HMMER pkg의 일부)은 이미 이 작업을 수행합니다. Sean의 프로그램 시도
코드에서 입력 형식을 추측하려면 현재 무엇을 지정해야 하는지 지정해야 합니다.
입력 및 출력 형식은 데이터가 다중 서열 정렬 또는
직선 시퀀스 파일.
용법:
bpsreformat -if INFORMAT -of OUTFORMAT -i FILENAME -o 출력.FORMAT
-h/--help 이 도움말을 인쇄하세요
-if/--informat 입력 형식을 지정합니다.
-of/--outformat 출력 형식을 지정합니다.
-i/--input 입력 파일 이름을 지정합니다.
(STDIN에서 데이터를 전달하려면 파일 이름으로 빼기 기호를 사용하십시오)
-o/--output 출력 파일 이름을 지정합니다.
(STDOUT에서 데이터를 전달하려면 빼기 기호를 파일 이름으로 사용하십시오)
--msa 다중 서열 정렬 데이터임을 지정합니다.
--special 특수 매개변수를 AlignIO/SeqIO에 전달합니다.
객체 - 대부분 Bio::AlignIO 객체용입니다.
쉼표로 구분된 다음 목록
nointerleaved - phylip의 경우 인터리브되지 않은 형식입니다.
idlinebreak -- phylip의 경우 molphy 형식으로 만듭니다.
백분율 - clustalw의 경우 한 줄에 % id를 표시합니다.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 bp_sreformatp를 사용하세요.
