이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 명령 e-PCR입니다.
프로그램:
이름
e-PCR — DNA 서열에서 STS(sequence tagged sites) 찾기
개요
e-PCR [-hV] [posix 옵션] sts 파일 [파스타 ...] [호환성 옵션]
기술
이 프로그램은 게놈에서 프라이머 쌍의 위치에 돌풍을 대체할 수 있습니다.
PCR 제품을 산출합니다.
옵션
posix 옵션은 다음과 같습니다.
-m=## 여백(기본값 50)
-w=## 단어 크기(기본값 7)
-n=## 허용되는 최대 불일치(기본값 0)
-g=## 허용되는 최대 삭제 수(기본값 0)
-f=## ## 불연속적인 단어 사용, ##>1이면 느리게
-오=## 출력 파일 설정
-t=## 출력 형식 설정:
1 - 클래식, 범위(pos1..pos2)
2 - 클래식, 중간점
3 - 표 형식
4 - 주석에 정렬된 표 형식(느림)
-d=##-## 기본 크기 범위 설정(기본값 100-350)
-p=+- 히트 후처리 켜기/끄기
-v=## 상세 플래그
-a=에이|에프 사전 크기 정렬 사용(간격 > 0인 경우에만), 느림
a - 항상 또는 f - 폴백으로
-x=+- 프라이머의 5'-end 소문자 마스킹 사용(기본값 -)
-u=+- 모든 프라이머를 대문자로 함(기본값 -)
호환성 옵션(중복 posix 옵션)은
M=## 여백(기본값 50)
W=## 단어 크기(기본값 7)
N=## 허용되는 불일치 수(기본값 0)
G=## 허용되는 최대 삭제 수(기본값 0)
F=## ## 불연속 단어 사용
O=## 출력 파일을 ##으로 설정
T=## 출력 형식 설정(1..3)
D=##-## 기본 크기 범위 설정
P=+- 후처리 적중 켜기/끄기
V=## 상세 플래그
A=에이|에프 사전 크기 정렬 사용(간격 > 0인 경우에만), 느림
a - 항상 또는 f - 폴백으로
X=+- 프라이머의 5'-end 소문자 마스킹 사용(기본값 -)
U=+- 모든 프라이머를 대문자로 함(기본값 -)
-중반 T=2와 동일
추가 옵션에 대한 정보는 전화로 문의하십시오. e-PCR 옵션 없이.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 e-PCR 사용
