이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 명령 gaeval입니다.
프로그램:
이름
gaeval - 성적표를 기반으로 유전자 모델의 적용 범위 및 무결성 점수 계산
정렬
개요
게발 [옵션] 정렬.gff3 유전자.gff3 [moregenes.gff3 ...]
기술
기본 옵션 :
-h|--도움
이 도움말 메시지를 인쇄하고 종료
-v|--버전
버전 번호를 인쇄하고 종료
무결성 점수 계산을 위한 가중치(합계가 1.0이 되어야 함):
-a|--알파: DOUBLE
확인된 인트론, 또는 단일 엑손 유전자에 대한 % 예상 CDS 길이; 기본값은 0.6입니다.
-b|--베타: DOUBLE
엑손 커버리지; 기본값은 0.3입니다.
-g|--감마: DOUBLE
% 예상 5' UTR 길이; 기본값은 0.05입니다.
-e|--엡실론: DOUBLE
% 예상 3' UTR 길이; 기본값은 0.05입니다.
무결성 점수 계산을 위한 예상 기능 길이:
-c|--exp-cds: INT
예상 CDS 길이(bp) 기본값은 400
-5|--exp-5putr: INT
예상 5' UTR 길이; 기본값은 200입니다.
-3|--exp-3putr: INT
예상 3' UTR 길이; 기본값은 100입니다.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인에서 gaeval 사용