이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 gbrowse 명령입니다.
프로그램:
이름
GBrowse2 - 일반 게놈 브라우저
개요
libgbrowse-펄 [-시간]
설치
Apache2가 시스템에 설치된 경우 소프트웨어는 URL을
GBrowse 디렉토리. 이를 고려하려면 Apache를 다시 시작해야 합니다.
설정은 /etc/gbrowse2/apache2.conf 파일에서 가능합니다.
다른 웹 서버를 사용하는 경우 apache2 템플릿을 참조하여 URL을 매핑해야 합니다.
같은 방식으로.
의존성
추가 기능을 제공하기 위해 추가 선택적 펄 종속성이 존재합니다. 참조하시기 바랍니다
자세한 내용은 INSTALL 파일의 선택적 모듈을 참조하십시오.
구성
찾아보기2 구성 파일은 /etc/gbrowse에 있습니다. 기본 구성 파일은
GBrowse.conf. 여기에는 전역 구성 요소가 포함됩니다. 특정 구성 파일
데이터 뱅크별로 동일한 디렉토리에 있습니다. 자세한 내용은
GBrowse 문서.
설치는 효모 게놈 샘플과 함께 제공됩니다.
기술
GBrowse는 간단하지만 고도로
구성 가능한 웹 기반 게놈 브라우저. 의 구성요소입니다
일반 모델 유기체 시스템 데이터베이스 프로젝트(GMOD).
일부 기능:
* 게놈의 동시 조감도 및 상세한 보기;
* 스크롤, 줌, 센터;
* 주석에 임의의 URL을 첨부합니다.
* 트랙의 순서와 모양은 관리자가 사용자 정의할 수 있으며
최종 사용자;
* 주석 ID, 이름 또는 주석으로 검색합니다.
* GFF 형식을 사용하여 타사 주석을 지원합니다.
* 설정은 세션 간에 유지됩니다.
* DNA 및 GFF 덤프;
* BioSQL 및 Chado를 포함한 다양한 데이터베이스에 대한 연결성;
* 다국어 지원;
* 타사 기능 로딩;
* 사용자 정의 가능한 플러그인 아키텍처(예: BLAST 실행, 덤프 및 가져오기
포맷, 올리고뉴클레오티드 찾기, 프라이머 디자인, 제한 맵 생성,
편집 기능).
WEB ACCESS
GBrowse는 URL에서 액세스할 수 있습니다. http://localhost/gbrowse2
onworks.net 서비스를 사용하여 gbrowse 온라인 사용
