이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 gene2xml 명령입니다.
프로그램:
이름
gene2xml - NCBI Entrez Gene ASN.1을 XML로 변환
개요
유전자2xml [-] [-b] [-c] [-i 파일 이름] [-l] [-o 파일 이름] [-p 통로] [-r 통로] [-t N] [-x]
[-y] [-z]
기술
유전자2xml Entrez Gene ASN.1을 XML로 변환하는 독립형 프로그램입니다. 엔트레즈 유전자
데이터는 NCBI ftp 사이트에 압축된 이진 Entrezgene-Set ASN.1 파일로 저장되며,
접미사를 가지고 .ags.gz. 이들은 압축된 XML 파일보다 몇 배 더 작습니다.
결과적으로 디스크 스토리지와 네트워크 대역폭이 크게 절약됩니다. 정상
gene2xml에 의한 처리는 이름은 같지만 .xgs 로
접미사.
옵션
아래에 옵션 요약이 포함되어 있습니다.
- 사용 메시지 인쇄
-b 파일이 바이너리입니다
-c 파일이 압축됨
-i 파일 이름
사용하지 않을 때 단일 입력 파일(기본적으로 표준 입력) -p
-l 로그 처리(사용 시 처리된 파일 나열 -p)
-o 파일 이름
사용하지 않을 때 단일 출력 파일(기본적으로 표준 출력) -p
-p 통로
파일 경로(전체 디렉토리를 처리하는 경우)
-r 통로
사용 시 결과 경로 -p; 기본적으로 입력 디렉토리
-t N 지정된 분류군 ID로 제한(당 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/)
-x .ags를 텍스트 .agc로 추출(이전에 배포된 형식)
-y .agc를 텍스트 .ags에 결합(테스트용)
-z .agc를 바이너리 .ags에 결합한 다음 gzip
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인에서 gene2xml 사용
