이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공자에서 실행할 수 있는 명령 genome-music-plot-mutation-relationp입니다.
프로그램:
이름
게놈 음악 플롯 돌연변이 관계 - 돌연변이 관계 결과에 대한 플롯을 만듭니다.
수단
버전
이 문서에서는 게놈 음악 플롯 돌연변이 관계 버전 0.04(2016-01-01)에 대해 설명합니다.
23:10:18)
개요
게놈 음악 플롯 돌연변이 관계 --입력-매트릭스=? --출력-pdf=?
[--skip-zero-mut-samples] [--genes-to-plot=?] [--plot-genes-in-order-listed]
필요한 인수
입력 행렬 끈
돌연변이 관계 도구로 생성된 유전자/샘플 매트릭스
출력-pdf 끈
플롯을 그리기 위한 출력 PDF 파일
선택 사항 인수
스킵-제로-뮤트-샘플 부울
어떤 유전자에도 돌연변이가 없는 샘플은 플로팅하지 마세요.
지정되지 않은 경우 기본값 'true'
noskip-zero-mut-샘플 부울
skip-zero-mut-samples를 'false'로 만듭니다.
유전자-플롯 끈
플롯할 유전자의 쉼표로 구분된 목록(예: DNMT3A, NPM1)
플롯 유전자 순서대로 나열 부울
유전자를 나열된 순서대로 표시합니다. 기본적으로 내림차순으로 표시합니다.
돌연변이 수에 따른 정렬
지정하지 않으면 기본값은 'false'(--noplot-genes-in-order-listed)입니다.
noplot-유전자-순서-목록 부울
plot-genes-in-order-listed를 'false'로 만듭니다.
기술
"music mutation-relation --mutation-matrix-file"을 사용하여 생성된 행렬이 주어지면 이 도구는
상호 배타성 또는 동시성을 강조하는 플롯을 생성합니다.
미리 정의된 유전자 집합의 돌연변이 상태.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 genome-music-plot-mutation-relationp를 사용하세요.
