이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 명령 geom입니다.
프로그램:
이름
geom - 데카르트 좌표의 분자 기하학 입력을 분석합니다.
기술
프로그램 기하학 일련의 데카르트 좌표를 읽고 그로부터 결합을 결정합니다.
거리(보어 및 옹스트롬), 결합각, 비틀림각, 평면외각
(선택 사항), 관성 모멘트 및 회전 상수.
파일 필요한
input.dat - 입력 파일
그리고 다음 중 하나:
geom.dat - 기하학 파일
file11.dat - PSI 형식 형상/구배 파일
파일 생성됨
geom.out - 분석이 포함된 파일
입력 옵션
XNUMXD덴탈의 기하학 프로그램에는 다음과 같은 옵션이 있습니다.
-h 도움말 정보를 인쇄합니다(이 옵션).
-에이스 [파일 이름]
각 라인이 원자로 구성된 ACES 출력 형식으로 입력을 읽습니다.
기호, 원자 번호 및 데카르트 좌표(보어). 선택적 인수
지오메트리 입력 파일의 이름이며 기본값은 다음과 같습니다. geom.dat.
-qchem [파일 이름]
QCHEM 출력 형식으로 입력을 읽으십시오. 각 줄은 원자로 구성됩니다.
숫자, 원자 기호 및 데카르트 좌표(옹스트롬 단위). 선택 사항
인수는 기하학 입력 파일의 이름이며, 기본값은 geom.dat.
-xyz [파일 이름]
XYZ 출력 형식으로 입력을 읽습니다. 첫 번째 줄에는 숫자가 포함됩니다.
원자와 두 번째 줄은 주석 줄입니다. 후속 라인에는 각각 다음이 포함됩니다.
원자 기호 및 데카르트 XY 및 Z 좌표(옹스트롬 단위). 선택 사항
인수는 기하학 입력 파일의 이름이며, 기본값은 geom.dat.
-앗 각도 abcd가 형성된 각도로 정의되는 면외 각도를 인쇄합니다.
벡터 ad와 원자 b, c, d로 정의된 평면에 의해.
DO_OOP = 부울
위에서 설명한 명령줄 스위치 -oop와 동일합니다.
동위 원소 = 매트릭스 of 실수/문자열
질량 중심 계산에 사용할 질량을 지정하는 데 사용됩니다.
회전 상수. 계산할 각 동위원소에 대해 하나의 배열이 제공됩니다.
배열은 동위원소를 지정하는 문자열과 부동 소수점 숫자를 혼합할 수 있습니다.
이 배열이 제공되지 않고 file11.dat가 존재하는 경우 질량은 다음과 같습니다.
file11의 원자 번호를 변환하여 얻습니다. 미사가 주어지지 않는 경우
ISOTOPES 또는 파일11을 사용하면 질량 관련 양이 계산되지 않습니다.
-g [파일 이름]
file11.dat가 아닌 파일에서 직교 좌표를 읽습니다. 파일명이 아닌 경우
주어진 경우 기본값은 geom.dat입니다. 대체 파일은 다음 형식으로 간주됩니다.
PSI의 geom.dat와 유사합니다. 이러한 파일에는 원자 번호가 포함되어 있지 않기 때문에
이 옵션을 사용하면 관성 모멘트와 회전 상수가 계산되지 않습니다.
사용.
읽기_GEOM = 부울
input.dat의 이 옵션은 기하학 PSI의 geom.dat에서 형상을 읽으려면
geom.dat 형식입니다.
-a 모든 쌍 거리에 대한 매개변수를 인쇄합니다.
PRINT_ALL_DIST = 부울
위에서 설명한 -a 플래그와 동일합니다.
-d 거리
다음보다 작은 원자 쌍과 관련된 매개변수만 인쇄합니다. 거리 보어
(기본값은 4.0 bohr).
PRINT_DISTANCE = 가치
위에서 설명한 -d 플래그와 동일합니다.
-옹스트롬
입력 좌표는 보어가 아닌 옹스트롬 단위입니다.
옹스트롬 = 부울
If TRUE, 입력 좌표는 보어 대신 옹스트롬입니다. 기본값은
그릇된.
다음 예는 물에 대한 기하학적 정보를 계산하는 것입니다.
여러 가지 동위원소. 기하학은 대신 geom.dat에서 읽혀집니다.
파일11.dat.
검: (
read_geom = 사실
동위원소 = (
(오오)
(이상한)
(O18 1.007825 1.007825)
))
5 월, 1998 기하학(1)
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 geom을 사용하세요.
