์ด๊ฒ์ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ ๋๋ MAC OS ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ์ ๊ฐ์ ์ฌ๋ฌ ๋ฌด๋ฃ ์จ๋ผ์ธ ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ค ํ๋๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ฌ OnWorks ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ์ ๊ณต์ ์ฒด์์ ์คํํ ์ ์๋ gmod_fasta2gff3.plp ๋ช ๋ น์ ๋๋ค.
ํ๋ก๊ทธ๋จ:
์ด๋ฆ
$O - FASTA๋ฅผ ๊ฐ๋จํ GFF3์ผ๋ก ๋ณํ
์๋์์ค
% $O [์ต์ ]
๋ช ๋ น์ค ์ต์
--fasta_dir ๋๋ ํ ๋ฆฌ์๋ fasta ํ์ผ์ด ํฌํจ๋์ด ์์ต๋๋ค.
(๊ธฐ๋ณธ๊ฐ: ./fasta)
--gfffilename ์์ฑํ GFF3 ํ์ผ ์ด๋ฆ
(๊ธฐ๋ณธ๊ฐ: ./out.gff)
--๊ฐ ๊ธฐ๋ฅ์ ํ ๋นํ SO ์ ํ์ ์ ๋ ฅํ์ธ์.
(๊ธฐ๋ณธ๊ฐ: EST)
--source ์์ค ์ด์ ํ์ํ ํ ์คํธ
(๊ธฐ๋ณธ: .)
--attributes ์ด 9์ ํ์ํ ์ถ๊ฐ ํ๊ทธ=๊ฐ ์
--nosequence ##FASTA ์น์ ์ ์ต์ ํฉ๋๋ค(์:
DNA ์์ด ์ธ์)
๊ธฐ์
์ด ์คํฌ๋ฆฝํธ๋ ๋จ์ํ fasta ํ์ผ ๋ชจ์์ ๊ฐ์ ธ์์ ๊ฐ๋จํ GFF3์ผ๋ก ๋ณํํฉ๋๋ค.
์ฐจ๋์ ์ ์ฌํ๊ธฐ์ ์ ํฉํฉ๋๋ค.
์๊ฐ
์ค์บ ์ผ์ธ[์ด๋ฉ์ผ ๋ณดํธ]>
์ ์๊ถ (c) 2006
์ด ๋ผ์ด๋ธ๋ฌ๋ฆฌ๋ ๋ฌด๋ฃ ์ํํธ์จ์ด์ ๋๋ค. ์ฌ๋ฐฐํฌ ๋ฐ/๋๋ ๋์ผํ ํ๊ฒฝ์์ ์์ ํ ์ ์์ต๋๋ค.
Perl ์์ฒด๋ก ์ฉ์ด.
onworks.net ์๋น์ค๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ฌ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก gmod_fasta2gff3.plp๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ญ์์ค.