Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 gt-eval 명령입니다.
프로그램:
이름
gt-eval - 주석 파일을 비교하고 정확도 측정(예측 대 참조)을 표시합니다.
개요
gt 평가 reference_file 예측_파일
기술
-nuc [예|아니요]
뉴클레오티드 수준 평가(메모리 소비는 입력 파일 크기에 비례함)
(기본값: 예)
-ltr [예|아니요]
유전자 예측 대신 LTR 레트로트랜스포존 예측을 평가합니다(모두
LTR_retrotransposon 요소는 결정되지 않은 가닥을 갖는 것으로 간주됩니다. (기본값:
아니요)
-ltdelta [가치]
LTR 테두리에 허용되는 델타를 동일한 것으로 간주하도록 설정합니다(기본값: 20).
-v [예|아니요]
장황하다(기본값: 아니오)
-o [파일 이름]
지정된 파일로 출력 리디렉션(기본값: 정의되지 않음)
-gzip [예|아니요]
gzip 압축 출력 파일 쓰기 (기본값: no)
-bzip2 [예|아니요]
bzip2 압축 출력 파일 쓰기 (기본값: no)
-힘 [예|아니요]
출력 파일에 강제 쓰기(기본값: no)
-도움
도움말 표시 및 종료
-번역
버전 정보 표시 및 종료
프로그램은 특정 기능 유형에 대한 민감도 및 특이도 값을 표시합니다(예:
유전자, mRNA, 엑손). 일부 기능 유형의 경우 누락되거나 잘못된 기능의 수
해당 유형도 표시됩니다. 따라서 "누락"은 해당 유형의 기능 수를 의미합니다.
"예측"에서 해당 유형의 기능과 중복되지 않는 "참조"입니다. 바이스
반대로, "잘못된"은 "예측"에서 나온 해당 유형의 기능 수를 나타냅니다.
"참조"의 해당 유형의 기능과 겹칩니다.
보고 버그
버그 보고[이메일 보호]>.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 gt-eval 사용
