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온웍스 파비콘

indigo-deco - 클라우드의 온라인

Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터를 통해 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 indigo-deco 실행

이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 indigo-deco 명령입니다.

프로그램:

이름


indigo-deco - 분자 스캐폴드 감지 및 R-그룹 디콘볼루션

개요


인디고 데코 파일 [매개 변수]

인디고 데코 -h

기술


인디고 데코 분자 스캐폴드 검출 및 R-그룹 디콘볼루션을 수행합니다. 수락됨
형식은 Molfile, SDFile, RDFile, SMILES 및 CML입니다.

옵션


인디고 데코 다음 매개변수를 허용합니다.

-h 도움말 메시지 인쇄

-a 대략적인 스캐폴드 계산(기본값은 정확함)

-s
molfile에 최대 발견 스캐폴드 쓰기

-S
발견된 모든 스캐폴드를 SD 파일에 씁니다.

-l
스캐폴드를 계산하지 말고 파일에서 로드하십시오.

-sr
파일에 R 사이트가 있는 스캐폴드 쓰기

-o
파일에 강조 표시된 결과 분자 쓰기

-r
파일에 분리된 r-그룹이 있는 결과 분자 쓰기

생성 방향성 고려 없음

-- 옵션의 끝을 표시합니다.

사용 예


인디고 데코 *.몰 -o hl.sdf -s scaf.sdf
현재 디렉토리의 molfile에서 분자를 읽고 최대 발견 스캐폴드를 저장합니다.
scaf.mol에 저장하고 강조 표시된 분자를 hl.sdf에 저장합니다.

인디고 데코 구조.몰 많은.sdf -s scaf.mol -S allscafs.sdf -r rg.sdf
structure.mol에서 하나의 분자를 읽고 many.sdf에서 여러 분자를 읽고 저장하십시오.
r-rgoups가 있는 분자를 rg.sdf에 저장하고 발견된 모든 스캐폴드를 allscafs.sdf에 저장합니다.

인디고 데코 *.smi -d readyscaf.mol -o hl.sdf
현재 디렉토리의 모든 SMILES 파일에서 여러 분자 읽기, 읽기
readyscaf.mol에서 스캐폴드하고 강조 표시된 분자를 hl.sdf에 저장합니다.

onworks.net 서비스를 사용하여 인디고 데코 온라인 사용


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