이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 명령 khmer입니다.
프로그램:
이름
크메르어 - k-mer 카운팅, 필터링 및 그래프 순회 FTW!
khmer는 k-mer 기반 데이터 세트 분석 및 변환을 수행하기 위한 라이브러리 및 툴킷입니다.
개요
크메르어 [옵션] 인수
예.
크메르어 카운팅에 로드 -x 1e8 -k 20 reads.ct reads.fa.gz
사용법
이 맨페이지는 크메르어 래퍼 스크립트. 소프트웨어 및
사용 방법은 /usr/share/doc/khmer 또는 기타를 참조하십시오. http://khmer.readthedocs.org/.
Debian/Ubuntu에서 패키지 관리자는 대량의 스크립트 모음을 직접 넣는 것을 피합니다.
시스템 PATH에. 대신 단일 래퍼 스크립트를 사용하여 스크립트를 시작합니다.
사용하고 싶다; 따라서 khmer 지침이 실행하라고 말하면 load-in-counting.py
...무엇이든... 이 명령에 접두사를 붙여야 합니다. 크메르어. 또한 .py 확장자는
생략할 수 있으므로 위에 표시된 형식의 명령이 생성됩니다.
이것이 마음에 들지 않으면 개인 PATH에 /usr/lib/khmer/bin을 추가하기만 하면 됩니다.
onworks.net 서비스를 사용하여 khmer 온라인 사용
