Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 lutefisk 명령입니다.
프로그램:
이름
lutefisk - 펩타이드 CID 스펙트럼의 새로운 해석을 위한 소프트웨어
개요
루테 피스크 [-q ] [ -m ] [ -d] [ -p ] [ -r ] [ -s ] [ -v] [ -h] [-o ]
기술
루테 피스크 펩타이드 CID 스펙트럼의 새로운 해석을 위한 소프트웨어입니다. 소요됩니다
펩타이드 CID 데이터 및 일부 보조 데이터 파일(이 중 위치는
명령줄) 모든 시퀀스를 가상으로 포함하는 결과 파일을 출력합니다.
CID 데이터와 일치합니다.
호출할 때 루테 피스크 와 더불어 -h 옵션을 선택하면 프로그램은 명령줄에 모든 항목을 나열합니다.
사용할 수 있는 옵션입니다.
옵션
-h 옵션 목록 인쇄
-q 정숙 모드로 실행
-m 전구체 이온 질량
-d 세부 정보 파일의 경로 이름
-p params 파일의 경로 이름
-r 잔여 파일의 경로 이름
-s 점수를 매길 데이터베이스 시퀀스가 있는 파일의 경로 이름
-v 자세한 정보 표시 모드에서 실행
-o 결과물 파일
CID 데이터 파일
프로그램 데이터
프로그램을 실행하는 데 필요한 데이터는 다음 위치에 있습니다. /usr/share/루테피스크.
예 데이터
예제 데이터는 다음 위치에 있습니다. /usr/share/doc/lutefisk/예제.
참고문헌 참조 ~까지 BE 인용
RS Johnson 및 JA Taylor(2002) "De novo 펩타이드를 통한 서열 데이터베이스 검색
sequencing by tandem Mass Spectrometry", Mol. Biotechnology Vol. 22, No. 3. (XNUMX월)
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직렬 질량 분석법에 의한 펩티드 서열 분석". Anal. Chem. 73:2594-2604.
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탠덤 질량 분석법에 의한 시퀀싱", "단백질 및 펩티드 분석: 발전
질량 분석법의 사용", 146:41-61(Methods in Molecular Biology 시리즈, Humana Press).
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직렬 질량 분석법에 의한 서열분석". Rapid Comm. Mass Spec. 11:1067-1075.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인에서 lutefisk 사용
