이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 명령 maskfeat입니다.
프로그램:
이름
maskfeat - 마스크된 기능으로 시퀀스 작성
개요
가면극 -순서 시퀄 [-유형 현] [-낮추다 비녀장] -마스크 문자 현 - outseq 분리
가면극 -도움
기술
가면극 EMBOSS("유럽 분자 생물학 오픈"의 명령줄 프로그램입니다.
소프트웨어 제품군”). "편집, 기능 테이블" 명령 그룹의 일부입니다.
옵션
입력 섹션에 있어야 합니다.
-순서 시퀄
추가 섹션에 있어야 합니다.
-유형 현
기본적으로 유형이 '반복'으로 시작하는 기능 테이블의 모든 기능은 마스킹됩니다.
마스킹하려는 피쳐 유형으로 설정할 수 있습니다. 보다
http://www.ebi.ac.uk/embl/WebFeat/ EMBL 기능 유형 목록은 다음을 참조하십시오.
Swissprot 사용자 설명서의 부록 A http://www.expasy.org/sprot/userman.html
Swissprot 기능 유형 목록은 유형은 '*'를 사용하여 와일드카드될 수 있습니다. 만약에
둘 이상의 유형을 마스킹하려면 이름을 공백이나 쉼표로 구분하십시오. 예:
*UTR 반복* 기본값: 반복*
-낮추다 비녀장
시퀀스 문자를 소문자로 변환하여 영역을 '마스킹'할 수 있습니다.
비엠보스 프로그램(예: fasta)은 이것을 마스크 영역으로 해석할 수 있습니다. 순서는
케이스 변경 외에는 변경되지 않습니다. 전체 시퀀스가
다음을 사용하여 지정된 영역을 소문자로 마스킹하기 전에 대문자입니다.
'-만찬' 플래그. 기본값: N
-마스크 문자 현
마스킹할 때 사용할 문자입니다. 기본값은 단백질 서열의 경우 'X', 핵산의 경우 'N'입니다.
시퀀스. 마스크 문자가 SPACE 문자 또는 null 문자로 설정된 경우,
그런 다음 시퀀스는 소문자로 변경하여 '마스킹'됩니다.
'-소문자' 플래그. 기본값: @($(acdprotein)?X:N)
산출 섹션에 있어야 합니다.
- outseq 분리
onworks.net 서비스를 사용하여 maskfeat 온라인 사용
