mincreshape - 클라우드의 온라인

프로그램:

이름

mincreshape - minc 파일에서 하이퍼슬래브를 잘라냅니다(차원 재정렬 포함).

개요

작은 모양 [ ] .mnc .mnc

기술

미니 셰이프의 주요 작업은 minc 파일에서 하이퍼슬래브를 잘라내어 새 파일에 넣는 것입니다.
minc 파일. "하이퍼 슬래브가 무엇입니까?"라고 묻습니다. 단순히 지정된 다차원 상자입니다.
시작 인덱스(복셀 좌표를 제공하는 벡터)와 카운트 벡터(수
각 축을 따라 복셀). 볼륨의 단일 슬라이스는 하이퍼슬래브입니다(카운트 1
슬라이스 방향), 큰 볼륨에서 꺼낸 작은 블록은 하이퍼슬래브이고,
다중 에코 MRI 데이터 세트의 단일 에코 볼륨은 하이퍼슬래브이며,
동적 획득은 하이퍼슬래브입니다. 아이디어를 얻을 수 있습니다. 체크 아웃 -스타트, -카운트 과
- 희미한 이 작업을 수행하는 방법에 대한 자세한 내용은 옵션을 참조하십시오(예제 참조). 만약 너라면
치수를 따라 한 점만 당기는 경우 다음을 수행하는 옵션이 있습니다.
차원이 사라지므로 작은 모양 의 차원을 줄이는 기능을 제공합니다.
밍크 파일. 또한 다음 범위에만 있는 하이퍼슬래브를 지정하도록 제한되지 않습니다.
입력 파일에서 입력 파일의 차원 경계를 넘어 확장할 수 있으며,
또한 차원을 따라 데이터를 뒤집을 수를 제공할 수 있습니다.

모든 것이 부족하다는 듯이, 작은 모양 차원을 재정렬하는 기능이 있습니다. 제일
명백한 경우는 가로 이미지를 관상 이미지로 변환하는 것입니다. 하지만 다음을 입력할 수 있습니다.
차원 이름 목록을 사용하여 임의의 차원 순서를 얻습니다.

더 원해!?! 알았어. 알았어. 미니 크레이프 모든 minc 라이브러리 ICV 작업을 수행합니다.
명령줄에서 사용할 수 있습니다. 정의된 것을 좋아하는 사람들에게 ICV는 이미지입니다.
변환 변수(내가 왜 그렇게 불렀는지 묻지 마세요)
어떤 모습일지 데이터. 즉, 당신을 위해 많은 변환을 수행합니다.
이러한 변환에는 복셀 값의 유형, 범위 및 정규화 변경이 포함됩니다.
지정된 이미지를 제공하기 위해 이미지를 확장하거나 축소합니다(복셀 복제 또는 평균화에 의해).
이미지 크기 및 벡터 이미지를 스칼라로 변환합니다.

혼동하지 않도록 여기에서 분명히 말씀드리겠습니다. 작은 모양 모든 일을 한다
ICV 변환을 먼저 수행한 다음 하이퍼슬래브 및 차원 재정렬 항목이 적용됩니다.
그 결과. 따라서 함께 혼합하려는 경우(예: -imgsize, -스타트, -카운트),
먼저 머리에 명확하게하십시오.

자, 자리를 비워두세요. 다음은 옵션 목록입니다.

옵션

옵션은 (고유한 한) 축약된 형식으로 지정할 수 있습니다.
명령줄의 아무 곳에나 지정할 수 있습니다.

일반 옵션

-2 MINC 2.0 형식 출력 파일을 만듭니다.

-소지품
기존 파일을 덮어씁니다.

-노클로버
기존 파일을 덮어쓰지 마십시오(기본값).

-말 수가 많은
복사된 각 데이터 청크에 대한 진행 정보를 인쇄합니다(기본값). 청크
치수를 다시 주문하는지 여부에 따라 크기가 다양하며
허용되는 내부 버퍼의 크기.

-조용한 진행 정보를 인쇄하지 마십시오.

-max_chunk_size_in_kb 크기
복사 버퍼의 최대 크기(KB)를 지정합니다. 기본값은 4096KB입니다.
(4메가).

영상 변환 옵션 (픽셀 유형 과 범위):

유형, 부호 및 유효 범위의 기본값은 입력 파일의 것을 사용하는 것입니다. 유형이 다음과 같은 경우
지정된 경우 부호와 유효 범위가 모두 해당 유형의 기본값으로 설정됩니다. 기호가
지정된 경우 유효한 범위가 유형 및 기호의 기본값으로 설정됩니다.

-파일 형식
유형 변환을 수행하지 마십시오(기본값).

-바이트 출력 복셀을 8비트 정수 형식으로 저장합니다.

-짧은 출력 복셀을 16비트 정수 형식으로 저장합니다.

-정수 출력 복셀을 32비트 정수 형식으로 저장합니다.

-긴 다음으로 대체됨 -정수.

-흙손 출력 복셀을 32비트 부동 소수점 형식으로 저장합니다.

-더블
출력 복셀을 64비트 부동 소수점 형식으로 저장합니다.

-서명
값을 부호 있는 정수로 작성합니다(short 및 long의 기본값). 무시됨
부동 소수점 유형.

-서명되지 않은
값을 부호 없는 정수로 작성합니다(바이트 기본값). 부동에 대해 무시됨
포인트 유형.

-유효한 범위 분 최대
정수 표현에서 출력 복셀 값의 유효한 범위를 지정합니다.
기본값은 유형 및 기호의 전체 범위입니다. 이 옵션은 다음에 대해 무시됩니다.
부동 소수점 값.

-이미지_범위 분 최대
이미지를 주어진 최소 및 최대 실제 값(복셀 값 아님)으로 정규화합니다.

-정규화
전체 입력 파일에 대해 이미지를 실제 최소값과 최대값으로 정규화합니다.

- 비정규화
이미지를 정규화하지 마십시오(기본값).

-노픽스필
입력 파일에서 범위를 벗어난 값을 변환하지 말고 그냥 복사하십시오.

-픽스필
입력 파일의 범위를 벗어난 값을 가능한 가장 작은 값(기본값)으로 바꿉니다.

-pixfill값 가치
입력 파일에서 범위를 벗어난 값을 대체하려면 새 픽셀 값을 지정하십시오.

영상 변환 옵션 (치수 방향 과 크기):

-스칼라
벡터 이미지를 스칼라 이미지로 변환합니다(벡터 이미지는 벡터_차원
가장 빠르게 변화하는 차원으로). 벡터 차원이 제거되고 값이
평균.

-노스칼라
벡터 이미지를 스칼라 이미지로 변환하지 마십시오(기본값).

+방향
공간 축에 양수 단계 값을 제공하도록 이미지를 뒤집습니다. 뒤집기에 주의하세요
공간 축의 수는 "이미지 치수"에만 적용됩니다. 이 두 가지가 가장 빠릅니다.
파일의 다양한(벡터가 아닌) 차원. 이미지가 아닌 것을 뒤집고 싶다면
차원을 사용하여 이미지 차원으로 변환할 수 있습니다. - 축소 딤네임= -1 (
-1은 실제로 크기를 변경하지 않음을 의미합니다). 예제를 확인하십시오.

-방향
공간 축에 대해 음수 단계 값을 제공하도록 이미지를 뒤집습니다.

-모든 방향
공간 축을 따라 이미지를 뒤집지 마십시오(기본값).

+x방향
양수 xspace:step 값을 제공하도록 이미지를 뒤집습니다(왼쪽에서 오른쪽으로).

-x방향
음수 xspace:step 값을 제공하도록 이미지를 뒤집습니다(오른쪽에서 왼쪽).

-xany방향
x축을 따라 이미지를 뒤집지 마십시오.

+y방향
양수 yspace:step 값(후방에서 전방으로)을 제공하도록 이미지를 뒤집습니다.

-y방향
음수 yspace:step 값을 제공하도록 이미지를 뒤집습니다(전후방).

-yany방향
y축을 따라 이미지를 뒤집지 마십시오.

+z방향
이미지를 뒤집어 양의 zspace:step 값(열등에서 우수)을 제공합니다.

-z 방향
음수 zspace:step 값(상위 대 열등)을 제공하도록 이미지를 뒤집습니다.

-잔디방향
Z축을 따라 이미지를 뒤집지 마십시오.

-지키다
이미지 크기를 조정할 때 종횡비를 유지합니다. 이는 복셀이 복제됨을 의미합니다.
(또는 평균) 각 이미지 차원을 따라 동일한 횟수.

-nokeepspect
이미지 크기를 조정할 때 종횡비를 강제로 유지하지 마십시오(기본값).

-imgsize 크기
원하는 이미지 크기를 지정합니다. -행 크기 or -콜사이즈 주어지지 않음).

-행 크기 크기
이미지에서 원하는 행 수를 지정합니다.

-콜사이즈 크기
이미지에서 원하는 열 수를 지정합니다.

- 축소 치수=크기
명명된 차원의 크기 지정(치수=크기). 크기 조정만
"이미지 치수"에 적용됨 - 일반적으로 가장 빠르게 변하는 두 가지(벡터가 아님)
치수. 차원 크기 조정을 수행하려면 가장 빠르게 변하는 모든 차원을
명명된 차원은 이미지 차원으로 바뀌고 다음의 영향을 받습니다.
방향 옵션. 차원 이름과 크기는 하나의 명령줄에 있어야 합니다.
인수이므로 공백을 사용하는 경우(괜찮습니다) 따옴표를 사용하여 숨깁니다.
껍질에서.

고쳐서 만들기 옵션 :

-횡축
가로 조각을 작성하십시오.

-시상
시상 조각을 작성하십시오.

-화관
관상 조각을 작성합니다.

- 이질화 dim1,dim2,dim3, ...
치수 순서를 지정합니다. 여기서 어둑한? 차원의 이름입니다. 당신은 줄 수 있습니다
파일에 존재하는 것보다 적은 차원: 가장 빠르게 변화하는 것으로 가정
출력 파일의 치수(그래서 -횡축 정확히 - 이질화
zspace,yspace,xspace). 다시 말하지만, 이름 사이에는 공백이 허용되지만 기억하십시오.
따옴표로 쉘에서 숨기십시오.

- 희미한 어둑한=스타트[,계산]
차원에 대한 차원 첨자의 범위 지정 어둑한. 면 계산 누락되었거나
0이면 1을 의미하지만 출력 파일에서 차원을 제거합니다(a
1의 개수는 크기 1)의 차원을 유지합니다. 부정적인 계산 데이터를 뒤집는 것을 의미합니다.
해당 차원을 따라 - 이 경우 스타트 가장 높은 복셀 좌표를 지정합니다.
차원(- 희미한 xspace=3,-3 뒤집힌 버전을 제공합니다
- 희미한 엑스스페이스=1,3). 옵션 -스타트 과 -카운트 대체 방법을 제공
동일한 정보를 지정합니다.

-스타트 좌표0,좌표1,좌표2, ...

하이퍼슬래브의 시작 모서리를 지정합니다(좌표는 가장 느린 변화
가장 빠른 차원). 치수보다 적은 좌표가 주어진 경우
파일에서 가장 느린 가변 차원에 적용되는 것으로 가정하고
나머지 좌표는 0으로 설정됩니다. 참조 - 희미한 상세 사항은. 둘 다 -스타트 과
-카운트 이미지 뒤에 입력 파일 치수에 해당하는 벡터 제공
변환(ICV) 옵션이 적용되었습니다.

-카운트 size0,size1,size2, ...
읽을 하이퍼슬래브의 가장자리 길이를 지정합니다(좌표는 가장 느린 가변
가장 빠른 차원). 파일에 존재하는 크기보다 적은 크기가 주어지면,
그런 다음 그들은 가장 느리게 변하는 차원에 적용되는 것으로 가정하고 나머지
크기는 차원의 전체 크기로 설정됩니다. 보다 - 희미한 자세한 내용은.
모두 -스타트 과 -카운트 입력 파일 치수에 해당하는 벡터를 제공하십시오.
이미지 변환(ICV) 옵션이 적용되었습니다.

누락 데이터 옵션 :

-노필
입력 볼륨(기본값) 외부에 있는 포인트에는 값 XNUMX을 사용합니다.

-채우다 입력 볼륨(가능한 최소 값) 외부의 점에 대해 채우기 값을 사용합니다.

- 채우기 값 가치
입력 볼륨 외부의 점에 대한 채우기 값을 지정합니다(실제 값,
픽셀 값이 아님).

일반적인 옵션 for 모든 명령 :

-도움 명령줄 옵션의 요약을 인쇄하고 종료합니다.

-번역
프로그램의 버전 번호를 인쇄하고 종료합니다.

예 :

차원이 zspace, yspace, xspace(가로)인 볼륨이 있다고 가정합니다.
크기는 128, 256, 256입니다. 슬라이스 40을 가져오려면(좌표를 유지하면서
zspace 차원에 대한 정보), 다음을 사용할 수 있습니다.

mincreshape 원본.mnc new.mnc -dimrange zspace=40,1

또는 다음을 사용할 수 있습니다.

mincreshape 원본.mnc new.mnc -start 40,0,0 -count 1,256,256

또는 단순히

mincreshape 원본.mnc new.mnc -start 40 -count 1

zspace 차원을 없애고 싶다면 다음을 사용할 수 있습니다.

mincreshape 원본.mnc new.mnc -dimrange zspace=40,0

가운데에서 블록을 가져와 xspace를 따라 뒤집습니다.

mincreshape 원본.mnc new.mnc \
-시작 40,10,240 -카운트 1,200,-200

그런데 왜 자제해야 합니까? 범위를 벗어나자:

mincreshape 원본.mnc new.mnc \
-시작 40,-100,340 -카운트 1,200,-200

시상 볼륨을 원하면 다음을 사용하십시오.

mincreshape 원본.mnc new.mnc -sagittal

옆머리는 어떻습니까 - x와 y를 뒤집습니다. 그리고 공간을 절약하기 위해 바이트로 변환하는 동안
우리는 그것에있어 :

mincreshape 원본.mnc new.mnc -dimorder xspace,yspace -byte

x,y,z 순서로 볼륨을 저장하는 것을 좋아합니다(z가 가장 빠르게 변합니다!
해!)? 괜찮아.

mincreshape 원본.mnc new.mnc -dimorder xspace,yspace,zspace

하지만 당신은 미니멀리스트입니다. 여기에 같은 것이 있습니다(하지만
다른 파일에 대해 중단될 수 있음):

mincreshape 원본.mnc new.mnc -dimorder zspace

모든 차원에 음수 단계 속성이 있는지 확인합시다(옵션 +방향 참조
자세한 내용은):

mincreshape original.mnc new.mnc -방향 -dimsize zspace=-1

onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 mincreshape 사용