이는 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공자에서 실행할 수 있는 명령 qualityScores입니다.
프로그램:
이름
qualityScores - subread 제품군의 구성 요소
사용법
품질 점수 [옵션] -i -o
필수 인수:
-i
읽은 데이터를 포함한 입력 파일 이름입니다. 기본 형식은 Fastq입니다.
-o
각 읽기 기반에 대한 Phred 점수를 포함하는 텍스트 파일인 출력 파일의 이름입니다.
선택적 인수:
--gzFASTQ 입력 입력 파일은 gzip으로 압축된 Fastq 형식입니다.
--BA 입력
입력 파일은 BAM 형식입니다.
--SA 입력
입력 파일은 SAM 형식입니다.
--첫 번째 끝
페어드엔드 데이터에서는 첫 번째 읽기만 사용합니다. 페어드엔드 BAM/SAM에만 적용됩니다.
입력.
--두 번째 끝
페어드엔드 데이터에서는 두 번째 읽기만 사용합니다. 페어드엔드 BAM/SAM에만 적용됩니다.
입력.
--카운트된 읽기 입력에서 추출할 총 읽기 수
파일. 기본적으로 10,000개입니다.
--phred-오프셋 <33|64>는 하위 읽기 정렬기를 참조합니다.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 qualityScores를 사용하세요
