이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 vcf-compare 명령입니다.
프로그램:
이름
vcf-compare - bgzipped 및 tabix 인덱싱된 VCF 파일 비교
개요
비교-vcf [옵션] 파일1.vcf 파일2.vcf ...
기술
정보: bgzipped 및 tabix 인덱싱된 VCF 파일을 비교합니다. (예: bgzip file.vcf, tabix -p VCF
파일.vcf.gz)
옵션
-c, --염색체
과 동일 -r, 이전 버전과의 호환성을 위해 왼쪽. 그대로 사용하지 말아주세요
앞으로 떨어졌다.
-d, -디버그
디버깅 정보. 옵션을 여러 번 제공하면 자세한 정보가 증가합니다.
-H, --cmp-일배체형
위치뿐만 아니라 일배체형 비교
-m, --이름 매핑
와 함께 사용 -H 열 이름이 다른 파일을 비교할 때. 이에 대한 주장
options는 쉼표로 구분된 목록이거나 파일의 줄당 하나의 매핑입니다. 이름은
콜론으로 구분되며 명령줄의 파일과 동일한 순서로 나타나야 합니다.
-R, --refseq
위치뿐만 아니라 실제 순서를 비교하십시오. 함께 사용 -w indel을 비교합니다.
-r, --지역
지정된 영역을 처리합니다(쉼표로 구분된 목록 또는 파일의 줄당 하나의 영역).
-s, --시료
나열된 샘플만 처리합니다. 원치 않는 샘플을 제외하면 증가할 수 있습니다.
성능이 상당히.
-w, --이기다
반복 시퀀스에서 동일한 indel이 다른 위치에서 호출될 수 있습니다.
이렇게 멀리 떨어진 레코드를 일치(SNP 또는 indel)로 간주합니다.
-h, -?, --도움
이 도움말 메시지입니다.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 vcf-compare 사용
