이는 최신 릴리스를 ambient-1.3.tar.gz로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 AMBIENT라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행하려면 AMBIENT라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하고 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
AMBIENT는 Linux 온라인에서 실행됩니다.
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기술
중요: BMC Sys Bio에 AMBIENT 분석법이 게시된 이후 몇 가지 업데이트가 이루어졌습니다. 논문에 사용된 버전을 사용하고 싶다면 v0.6.3이지만, 동일한 방식으로 작동하지만 추가 옵션이 있고 안정성과 성능이 개선된 최신 버전을 사용하는 것이 좋습니다. 관심을 가져 주셔서 감사합니다!AMBIENT(Bipartite Networks용 활성 모듈)는 시뮬레이션된 어닐링을 사용하여 일부 일관된 특성을 갖는 대사 네트워크(모듈) 영역을 찾는 Python 모듈입니다. AMBIENT는 미리 정의된 경로를 필요로 하지 않으며 영향을 받는 대사 영역에 대해 매우 구체적인 예측을 제공합니다.
예를 들어, 주석이 달린 인코딩 유전자의 전사 데이터를 기반으로 한 반응 점수는 네트워크에서 사용할 수 있으며 조정된 발현 변화 모듈을 찾을 수 있습니다. 이것은 동시에 더 유연하고 더 구체적인 경로/유전자 집합 농축 분석에 대한 대안을 제공합니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
Python
이것은 https://sourceforge.net/projects/ambient-bio/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
