이것은 Grinder-0.5.4.tar.gz로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 Grinder라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
Grinder라는 이 앱을 다운로드하여 온라인으로 실행하면 OnWorks를 통해 Linux 온라인에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
Linux 온라인에서 실행되는 그라인더
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기술
Grinder는 모든 주요 시퀀싱 플랫폼에 대해 시뮬레이션된 omic 샷건 및 앰플리콘 시퀀스 라이브러리를 생성하기 위한 다목적 오픈 소스 생물정보학 도구입니다.특징
- 샷건 또는 앰플리콘(예: 16S rRNA) 읽기 라이브러리
- omics는 게놈, transcriptomic, proteomic, metagenomic, metatranscriptomic 또는 metaproteomic 데이터 세트 생성을 지원합니다.
- 임의 읽기 길이 분포 및 읽기 횟수
- PCR 및 시퀀싱 오류 시뮬레이션(키메라, 점 돌연변이, 호모폴리머)
- 페어드 엔드(메이트 페어) 데이터 세트 지원
- 특정 순위 풍부 설정 또는 각 게놈, 유전자 또는 단백질에 대해 수동으로 주어진 풍부
- 주어진 풍부함(알파 다양성)을 가진 데이터 세트 생성
- 관련 데이터 세트는 다양한 수의 게놈(베타 다양성)을 공유할 수 있습니다.
- 다양한 게놈 길이 또는 유전자 카피 수에 의해 생성된 편향 모델링
- 선호하는 옵션을 저장하는 프로필 메커니즘
- GUI, CLI 및 API와 같은 여러 인터페이스를 통해 생물학자 또는 고급 사용자가 사용 가능
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
콘솔/터미널
프로그래밍 언어
펄
이것은 https://sourceforge.net/projects/biogrinder/에서도 가져올 수 있는 응용 프로그램입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
